Το Εργαστήριο Ανατομίας και Φυσιολογίας Αγροτικών Ζώων του Γ.Π.Α. ιδρύθηκε το 1920 με την επωνυμία: “Εργαστήριο Ανατομίας, Φυσιολογίας, Υγιεινής και Στοιχείων Κτηνιατρικής” στην τότε Ανωτάτη Γεωπονική Σχολή Αθηνών (Α.Γ.Σ.Α. – σημερινό Γ.Π.Α.) με πρώτο Διευθυντή τον Καθηγητή Χρήστο Πασιόκα.
Κατά τη μεταφορά της Α.Γ.Σ.Α. στη Θεσσαλονίκη (1937-1943), ο Χ. Πασιόκας παρέμεινε στην Αθήνα και θεωρείται ότι “διέσωσε” το Κτηνοτροφείο της Σχολής στα δύσκολα χρόνια της Κατοχής.
Μετά την επαναφορά της Α.Γ.Σ.Α. στην Αθήνα, ο Χ. Πασιόκας ανέλαβε και πάλι τη Διεύθυνση του Εργαστηρίου ως το 1958, οπότε τον διαδέχθηκε ο Καθηγητής Κωνσταντίνος. Μελανίδης. Τη χρονιά εκείνη έγινε συγχώνευση του “Εργαστηρίου Ανατομίας, Φυσιολογίας, Υγιεινής και Στοιχείων Κτηνιατρικής” και του “Εργαστηρίου Μικροβιολογίας” (του οποίου Διευθυντής ήταν ο Κ. Μελανίδης από το 1949).
Το 1960 ιδρύθηκε η Έδρα Ανατομίας και Φυσιολογίας Aγροτικών Ζώων την οποία διηύθυνε ο Κ. Μελανίδης ως το 1965. Διευθυντές του Εργαστηρίου ανέλαβαν στη συνέχεια οι Καθηγητές Κωνσταντίνος Ταρλατζής (1965-1974) και Ευθύμιος Ν. Στοφόρος (1974-1997). Το όνομα του τελευταίου έχει δοθεί τιμητικά σε μερικούς κτηριακούς χώρους που καταλαμβάνει το Εργαστήριο σήμερα.
Από το 1997 ως το 2011 ανέλαβε Διευθυντής ο Καθηγητής κος Ιωάννης Γ. Μενεγάτος, ακολούθως ο Καθηγητής Γεώργιος Ι. Θεοδωρόπουλος (2011-2015), μετέπειτα ο Καθηγητής κος Ιωάννης Μπόσης (2016-2019) και στη συνέχεια η Καθηγήτρια κα Χαδιώ-Μάντζαρη Στυλιανή (2019-2021) την οποία διαδέχθηκε ο Επίκουρος Καθηγητής Χρήστος Μπαλάσκας το 2022.